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尼安德特人是現(xiàn)代人類最著名的已滅絕近親，他們過去生活在歐洲和亞洲的部分地區(qū)，大約在在4萬年前前后消失。
最近的一項研究指出，這種十分聰明的人類物種在大約4.7萬年前，與現(xiàn)代智人（也就是我們）有過一次雜交熱潮，以至于現(xiàn)代人類的DNA中包含了尼安德特人基因組的幾乎所有片段。
只有一條染色體除外，那就是Y染色體，尼安德特人的Y染色體在現(xiàn)代智人中完全找不到。
那么，有趣的問題是，尼安德特人的 Y 染色體到底怎么了？
尼安德特人的基因組
大約76.5萬至55萬年前，尼安德特人和現(xiàn)代智人祖先在非洲各奔東西。當(dāng)時，尼安德特人遷徙到歐洲，而現(xiàn)代智人的祖先則留在了原地。
在13萬到11萬年前，現(xiàn)代智人的祖先第一次走出非洲，但這次遷徙以失敗告終，并最終在近東地區(qū)逐漸消失。
直到5 萬至4萬年前，現(xiàn)代智人再次遷徙到歐洲和亞洲?，F(xiàn)代智人的重大轉(zhuǎn)變被認(rèn)為發(fā)生在7萬年前前后——變得有別于其它人屬物種，所以這次遷徙直接讓尼安德特人消失在了歷史舞臺。
得益于保存完好的歐洲和亞洲尼安德特人骨骼和牙齒的DNA，科學(xué)家已經(jīng)恢復(fù)了完整的男性和女性尼安德特人的基因組副本。
不出所料，尼安德特人的基因組與我們非常相似，他們同樣包含約20000多個基因，捆綁在23條染色體上。
另一方面，他們也有22對常染色體——兩個副本分別來自父母，還有一對性染色體，女性擁有兩條X染色體，而男性則擁有一條X染色體和一條Y染色體。
科學(xué)家有許多方法在智人的基因組中尋標(biāo)記到尼安德特人的DNA序列片段，所以我們現(xiàn)在知道，除起源于非洲的人類譜系外，現(xiàn)在所有人的體內(nèi)都包含有尼安德特人的基因。
其中，歐洲起源的人類譜系的基因組中包含了2%的尼安德特人基因系列，而亞洲和印度的譜系比例還會更高一點。
不過，尼安德特人的基因似乎正在被我們逐漸剔除，因為已知一些古代智人基因組中含有的尼安德特人 DNA 序列更多，有些達(dá)到6%左右。
也正因為我們知道什么基因來自尼安德特人，所以我們知道哪些特征是尼安德特人帶給我們的。
其中包括紅頭發(fā)等外表特征，還有關(guān)節(jié)炎、狼瘡等疾病都與尼安德特人的基因有關(guān)，當(dāng)然他們的基因也帶給了我們對許多疾病的抵抗力。
但是，所有這些基因都與Y染色體無關(guān)，目前沒有發(fā)現(xiàn)現(xiàn)代智人攜帶尼安德特人Y染色體的任何部分。
Y染色體很難測序，因為它含有大量重復(fù)的“垃圾DNA”，因此尼安德特人的Y染色體基因組僅進(jìn)行了部分測序。
科學(xué)家在已測序的尼安德特人Y染色體上發(fā)現(xiàn)了現(xiàn)代智人Y 染色體中幾種相同基因的樣本，但沒有在現(xiàn)代智人的Y染色體上發(fā)現(xiàn)尼安德特人的部分。
值得一提的是，在現(xiàn)代人類中，一個名為SRY的Y染色體基因啟動了男性的發(fā)育，SRY基因在所有猿類中都發(fā)揮著這一作用，或許也包括尼安德特人，但目前還沒有發(fā)現(xiàn)尼安德特人的SRY基因。
尼安德特人的 Y 染色體怎么了？
其實，有許多原因都會導(dǎo)致尼安德特人的Y染色體在今天不出現(xiàn)在現(xiàn)代智人身體中。
有人認(rèn)為，尼安德特人的Y 染色體從未出現(xiàn)在跨物種雜交中，因為只有現(xiàn)代智人的男性愛上（或者其它暴力手段）尼安德特女性，而沒有尼安德特人男性愛上現(xiàn)代智人女性。
不過，這個想法很難與現(xiàn)代人類中沒有尼安德特人線粒體DNA的痕跡(僅限于女性系)的發(fā)現(xiàn)相協(xié)調(diào)。
也有人認(rèn)為，由于尼安德特人種群數(shù)量非常少，所以擁有有害基因積累的可能性非常高，所以尼安德特人的 Y 染色體在工作方面不如其競爭對手智人那么出色。
由于那些帶有特別有用的基因的 Y 染色體（比如產(chǎn)生更多、更好或更快的精子）會迅速取代群體中的其他 Y 染色體，所以隨著時間推移，尼安德特人的Y染色體基因組在現(xiàn)代智人中完全消失。
另外，考慮到人類的 Y 染色體總體上正在退化，所以也可能尼安德特人的 Y 染色體中 SRY 基因已經(jīng)丟失，他們靠其它方式?jīng)Q定性別，所以他們的Y染色體遠(yuǎn)沒有現(xiàn)代智人的有用，也就逐漸就消失了。
還有一種最有可能的原因，就是尼安德特人的Y染色體無法與現(xiàn)代人類其他染色體上的基因一起工作，導(dǎo)致帶有Y染色體的混血不育。
獅虎獸
在物種雜交中，如果有一方不育、罕見或不健康，那么它基本都是具有不同性染色體的那一方。
這個被稱為霍爾登法則，比如在哺乳動物中，雄性擁有XY染色體，那么雄性雜交后代不健康或不育的比例就更高；
而在鳥類中，雄性有ZZ染色體，雌性有ZW染色體，所以它們是雌性雜交后代不健康或不育的比例就更高。
霍爾登法則的具體原因還不是很明確，但是它確實普遍影響生物，例如你可能知道獅子和老虎雜交的獅虎獸，它們雌性有生育能力，但雄性都不育，就是這種情況。
攜帶尼安德特人Y染色體的混血不生兒子或者根本就不生孩子，那么Y染色體自然就會消失了。
尼安德特人到底如何滅絕的？
你會發(fā)現(xiàn)，無論出于哪種原因，碰到現(xiàn)代智人并與之雜交后，尼安德特人自己的繁育肯定出了巨大的問題。
他們要么因為可生育人口減少了——被現(xiàn)代智人占有，要么因為混血不育或者有害基因的存在被淘汰，總之碰到現(xiàn)代智人之后，他們種群肯定是萎縮了，這對于本身就人丁凋落的他們來說是雪上加霜。
每個人都想知道尼安德特人是如何滅絕的，其實現(xiàn)在有一個認(rèn)可度較高的原因，那就是他們真的生育出現(xiàn)了問題。
尼安德特人和現(xiàn)代智人在歐洲共同生活了4000-10000年，2019年一項研究指出，這個重疊的時間要遠(yuǎn)長于現(xiàn)代智人通過戰(zhàn)爭或流行病等方式滅絕尼安德特人所需的時間。
這項研究還指出，只要生育率略有下降，那么隨著時間推移，這種積累就會成為他們最終走向滅絕的重要因素。
其實，不僅現(xiàn)代智人通過這種“基因污染”的方式讓尼安德特人最終滅亡，現(xiàn)在許多強(qiáng)勢的入侵物種也都是這么做的。
我們知道入侵物種通常會和本土相同生態(tài)位上的物種存在資源的競爭，這通常被認(rèn)為是本土物種滅絕的主要原因。
其實，對于許多物種來說，基因污染也是相當(dāng)關(guān)鍵，甚至可能就是摧毀一個物種的最后一根稻草。
報道原文：https://theconversation.com/modern-human-dna-contains-bits-from-all-over-the-neanderthal-genome-except-the-y-chromosome-what-happened-230984
參考：
[1].https://doi.org/10.1126/science.zf18669
[2].https://doi.org/10.1371/journal.pone.0216742
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